1946 yılında Vezirköprü, Samsun’da doğmuştur. Askerlik hayatına 1960 yılında Hava Lisesi’nde başlamıştır.

1965 yılında Hava Harp Okulu’ndan mezun olan Orgeneral Cömert, uçuş eğitimini tamamlayarak Jet Pilotu olarak Türk Hava Kuvvetleri saflarına katılmıştır.

Hava Harp Akademisi ve Silâhlı Kuvvetler Akademisi'ni bitiren Orgeneral Cömert, ABD’de Hava Komuta Kurmay Koleji ve Akademik Öğretmen Okulu’ndan mezun olmuştur. Değişik üslerde eğitim subaylığı, harekât subaylığı ve filo komutanlığı yapan Orgeneral Cömert, 1985-1988 tarihleri arasında Napoli Airsouth NATO Karargâhında yurt dışı görevinde bulunmuştur. Harekât Komutanlığı ve Harekât Başkanlığı görevlerini de başarı ile tamamlayıp, 1991 yılında Tuğgeneral’liğe terfi etmiştir.

Tuğgeneral olarak 2. Takım Hava Kuvvetleri Kurmay Başkanlığı görevini bir yıl sürdüren Orgeneral Cömert, 8. Ana Jet Üs Komutanlığı görevine atanmış, 1994 yılında da Genekurmay Komuta Kontrol Daire Başkanlığı görevini icra etmiştir. 1995 yılında Tümgeneralliğe terfi ederek Hava Harp Okulu Komutanlığı’na atanmıştır. Bu görevi iki yıl sürdüren Orgeneral Cömert, 1997-1999 tarihleri arasında Genelkurmy And. Daire Başkanlığı görevini sürdürmüş ve aynı yıl Korgeneralliğe terfi ederek, Hava Kuvvet Komutanlığı Değ.Dent. Başkanlığı'na atanmıştır. 2001 yılı general atamaları ile birlikte 1. Taktik Hava Kuvvetleri ve 6. BHHM Komutanlığı görevine atanan Orgeneral Cömert, 30 Ağustos 2003 tarihinden itibaren Orgeneralliğe terfi etmiştir.

2003-2005 yılları arasında Harp Akademileri Komutanlığını sürdüren Orgeneral Cömert, 2005 yılı General/Amiral atamaları ile Hava Kuvvetleri Komutanlığı görevine atanmıştır. 23 Ağustos 2007 tarihinde emekli olmuştur.

12 Eylül Askeri Darbesi öncesinde yaşanan Türkiye'nin siyasi kutuplaşma döneminde, 11 Temmuz 1978 öldürülen Hacettepe Üniversitesi Sanat Tarihi Bölümü öğretim üyesi Bedrettin Cömert'in kardeşidir.

Özay Cömert ile evli olan Orgeneral Faruk Cömert iki çocuk babasıdır. İngilizce bilmektedir.